Die Partner des EMS
- Bischöfliche Kirche in Jerusalem und dem Nahen Osten, Diözese Jerusalem
- Brüder-Unität in in Südafrika (MCSA)
- Christlich-Evangelische Kirche in Halmahera (GMIH), Indonesien
- Christlich-Evangelische Kirche in Minahasa (GMIM), Indonesien
- Christlich-Protestantische Kirche in Bali (GKPB), Indonesien
- Christliche Kirche von Südsulawesi (GKSS), Indonesien
- Kirche von Südindien (CSI)
- Nationale Evangelische Kirche in Beirut (NEC), Libanon
- Presbyterianische Kirche von Ghana (PCG)
- Presbyterianische Kirche von Korea (PCK)
- Presbyterianische Kirche in der Republik Korea (PROK)
- Protestantisch-Indonesische Kirche in Donggala (GPID), Indonesien
- Protestantisch-Indonesische Kirche in Luwu (GPIL), Indonesien
- Protestantische Kirche in Südost-Sulawesi (Gepsultra), Indonesien
- Toraja Kirche (GT), Indonesien
- Toraja Mamasa Kirche (GTM), Indonesien
- Vereinigte Kirche Christi in Japan (Kyodan)
Außerdem ist das EMS dem Chinesischen Christenrat (CCC) und der Amity Foundation freundschaftlich verbunden.
